DNA主要分布于細胞核中，另外細胞質的線粒體和葉綠體中也有少量的DNA。RNA主要分布于細胞質中，細胞核的核仁中也有少量的RNA。DNA是脫氧核糖核酸，RNA是核糖核酸。

脫氧核糖核酸，縮寫為DNA，是生物細胞內含有的四種生物大分子之一核酸的一種。DNA攜帶有合成RNA和蛋白質所必需的遺傳信息，是生物體發育和正常運作必不可少的生物大分子。

核糖核酸，縮寫為RNA，存在于生物細胞以及部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。RNA由核糖核苷酸經磷酸二酯鍵縮合而成長鏈狀分子。

由于DNA和RNA在化學組成與分子結構上存在一定的差別，因而對不同的染料有著不同的反應。所以，可以根據這一反應差異，來研究細胞中DNA與RNA的分布情況，DNA主要分布在細胞核中，RNA主要分布在細胞質中。

DNA和RNA兩種核酸分子都是多聚體，但是它們的聚合程度有所不同。DNA聚合程度高，易于甲基綠結合;RNA聚合程度低易于吡羅紅結合。所以當吡羅紅與甲基綠混在一起作為染料時吡羅紅與核仁、細胞質中的RNA選擇性結合，從而顯示紅色;甲基綠與染色質中的DNA選擇性結合，從而顯示綠色。綜上所述，RNA對吡羅紅的親和力大，被染成紅色;DNA對甲基綠的親和力大，被染成綠色。