1905年，于右任、邵力子等原震旦公學(xué)學(xué)生脫離震旦，擁戴馬相伯在吳淞創(chuàng)辦復(fù)旦公學(xué)。校名擷取自《尚書大傳•虞夏傳》“卿云爛兮，糾縵縵兮；日月光華，旦復(fù)旦兮”兩句中的“復(fù)旦”二字，本義是追求光明，寓含自主辦學(xué)、復(fù)興中華之意。馬相伯、嚴復(fù)等先后擔(dān)任校長。1913年李登輝開始擔(dān)任校長，一直到1936年。在他長達23年的校長任內(nèi)，復(fù)旦發(fā)展成為一所以培養(yǎng)商科、經(jīng)濟、新聞、教育、土木等應(yīng)用型人才聞名的、有的私立大學(xué)，形成了從中學(xué)到研究院的完整的辦學(xué)體系。

1937年抗日戰(zhàn)爭爆發(fā)后，復(fù)旦部分師生在吳南軒校長帶領(lǐng)下，輾轉(zhuǎn)內(nèi)遷重慶北碚（渝校）。1941年增設(shè)了農(nóng)學(xué)院。經(jīng)國民政府行政院批準，1942年元旦復(fù)旦由私立改為國立，全稱為國立復(fù)旦大學(xué)，吳南軒、章益先后出任校長。1946年夏，渝校遷回上海江灣原址，與滬校合并，學(xué)校的規(guī)模進一步擴大。

兩次騰飛

1949年6月，上海市軍管會接管復(fù)旦。軍管會任命張志讓、陳望道擔(dān)任校務(wù)委員會正副主任委員。1952年2月，中共復(fù)旦大學(xué)委員會成立，李正文任書記。1952年8月至9月，華東地區(qū)進行院系大調(diào)整，復(fù)旦大學(xué)成為人文社會和自然科學(xué)的全國重鎮(zhèn)，奠定了后50年學(xué)科發(fā)展的基本格局和師資基礎(chǔ)。

1954年，楊西光出任復(fù)旦大學(xué)黨委書記。1956年復(fù)旦第一次黨代會召開。五六十年代，楊西光、王零領(lǐng)導(dǎo)的學(xué)校黨委支持校長陳望道狠抓教學(xué)質(zhì)量，充分發(fā)揮老專家、老教授的作用，有計劃、有重點地系統(tǒng)培養(yǎng)中青年骨干教師。期間，復(fù)旦的辦學(xué)質(zhì)量和辦學(xué)條件都有矚目的長足發(fā)展，形成了有的學(xué)科高原。1949?1966年，復(fù)旦培養(yǎng)的學(xué)生中有70余人日后當選為中國科學(xué)院或中國工程院院士，這個人數(shù)在全國高校中名列第三。

1958年“大躍進”，復(fù)旦大學(xué)理科新建了計算數(shù)學(xué)、力學(xué)、原子核物理、放射化學(xué)、無線電電子學(xué)、生物物理、生物化學(xué)等新專業(yè)。此前，文科重建了法律系、哲學(xué)系。這些新專業(yè)的創(chuàng)建，標志著復(fù)旦開始探索有自己的綜合大學(xué)之路。1959年，復(fù)旦大學(xué)被列為全國16所重點大學(xué)之一。1966年到1976年，復(fù)旦大學(xué)成為“文革”的重災(zāi)區(qū)，教學(xué)科研受到重創(chuàng)。

1977年，復(fù)旦大學(xué)恢復(fù)招收本科生，次年恢復(fù)招收研究生。1978年，蘇步青出任校長、黨委委員，夏征農(nóng)出任黨委第一書記，進行了一系列撥亂反正工作，同時倡導(dǎo)民主辦校，推動解放運動。1983至2011年，謝希德、華中一、楊福家、王生洪、楊玉良先后出任校長，盛華、林克、錢冬生、程天權(quán)、秦紹德、朱之文先后出任黨委書記。

跨越發(fā)展

1984年，復(fù)旦大學(xué)成立研究生院。同年，再次被國務(wù)院批準為國家重點建設(shè)的10所高校之一。1993年2月，復(fù)旦大學(xué)提出了“追求優(yōu)質(zhì)，爭創(chuàng)一流，明確復(fù)旦作為高校國家隊的坐標位置”的發(fā)展大計，并逐步確立“建設(shè)世界一流大學(xué)”的總體奮斗目標。

1994年，復(fù)旦大學(xué)通過由國家教育部組織的“211工程”部門預(yù)審，提出了在21世紀初期，將復(fù)旦大學(xué)建設(shè)成為高層次人才培養(yǎng)、高水科學(xué)研究、高科技成果轉(zhuǎn)讓和高規(guī)格決策咨詢的中心和基地，成為學(xué)術(shù)活躍、學(xué)科鮮明、綜合實力雄厚、精神面貌健康奮發(fā)、與上海國際化大都市地位相稱的、具有世界一流水的綜合大學(xué)的總體奮斗目標，為此后十年制定了發(fā)展藍圖。1995年5月22日，江澤民為復(fù)旦大學(xué)題詞：“面向新世紀，把復(fù)旦大學(xué)建設(shè)成為具有世界一流水的綜合性大學(xué)。”

1999年國家教育部、上海市政府簽定共建復(fù)旦大學(xué)的協(xié)議，復(fù)旦成為“985工程”的首批建設(shè)高校。2000年4月27日，復(fù)旦大學(xué)與上海醫(yī)科大學(xué)強強聯(lián)合，成立新的復(fù)旦大學(xué)。

2005年復(fù)旦大學(xué)百年華誕。、、中央胡錦濤發(fā)來賀信，希望復(fù)旦大學(xué)發(fā)揚優(yōu)良傳統(tǒng)，不斷開拓創(chuàng)新，努力建設(shè)成為具有世界一流水的綜合性大學(xué)，為偉大事業(yè)培養(yǎng)更多德才兼?zhèn)涞母咚刭|(zhì)人才，為全面建設(shè)小康社會、實現(xiàn)中華民族的偉大復(fù)興作出新的更大的貢獻。