新疆醫科大學第四輪學科評估于2016年4月啟動,按照“自愿申請、免費參評”原則,采用“客觀評價與主觀評價相結合”的方式進行。評估體系在前三輪的基礎上進行諸多創新;評估數據以“公共數據和單位填報相結合”的方式獲取;評估結果按“分檔”方式呈現,具體方法是按“學科整體水得分”的位次百分位,將前70%的學科分9檔公布:前2%(或前2名)為A+,2%~5%為A(不含2%,下同),5%~10%為A-,10%~20%為B+,20%~30%為B,30%~40%為B-,40%~50%為C+,50%~60%為C,60%~70%為C-。

| 序號 | 學校代碼 | 學校名稱 | 一級學科代碼 | 一級學科名稱 | 評選結果 |
| 1 | 10760 | 新疆醫科大學 | 1007 | 藥學 | B- |
| 2 | 10760 | 新疆醫科大學 | 1002 | 臨床醫學 | C+ |
| 3 | 10760 | 新疆醫科大學 | 1004 | 公共衛生與預防醫學 | C |
| 4 | 10760 | 新疆醫科大學 | 1006 | 中西醫結合 | C |
| 5 | 10760 | 新疆醫科大學 | 1001 | 基礎醫學 | C- |
| 6 | 10760 | 新疆醫科大學 | 1011 | 護理學 | C- |
學校擁有雪蓮山校區、新醫路校區、鯉魚山校區、明園校區、倉房溝校區5個校區;8所直屬附屬醫院,均為三級甲等醫院,各附屬醫院協同發展、整體聯動,形成了優勢集中、各有、分布合理、實力強勁的醫療資源集群。
學校現有全日制在校生27901人,教職工18443人(大學1550人,附屬醫院16893人)。擁有首批“全國黃大年式教師團隊”1個,國家級教學名師1人,全國中醫藥高等學校教學名師1人,國醫大師1人,全國名中醫2人,“國家級百千萬人才工程”7人,67位專家享受國務院政府特殊津貼,2人獲評“全國優秀共產黨員”,6人獲評“全國五一勞動獎章”。










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