南京中醫(yī)藥大學(xué)始建于1954年，歷經(jīng)江蘇省中醫(yī)進(jìn)修學(xué)校、江蘇省中醫(yī)學(xué)校、南京中醫(yī)學(xué)院、江蘇新醫(yī)學(xué)院、南京中醫(yī)學(xué)院等歷史時期，是全國建校最早的中醫(yī)藥高等院校之一，是江蘇省重點(diǎn)建設(shè)高校，也是江蘇省人民政府與國家中醫(yī)藥管理局共建高校。建校60多年來，南京中醫(yī)藥大學(xué)為新中國高等中醫(yī)教育培養(yǎng)輸送了第一批師資、主持編寫了第一套教材和教學(xué)大綱，培養(yǎng)了新中國中醫(yī)藥界最早的學(xué)部委員，為新中國中醫(yī)高等教育模式的確立和推廣做出了重要貢獻(xiàn)，被譽(yù)為“中國高等中醫(yī)教育的搖籃”。

學(xué)校坐落于鐘靈毓秀、虎踞龍蟠的古都南京，擁有仙林和漢中門兩個校區(qū)。現(xiàn)有各類在校生2萬名，設(shè)有基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院、第一臨床醫(yī)學(xué)院、第二臨床醫(yī)學(xué)院、醫(yī)學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院、藥學(xué)院、衛(wèi)生經(jīng)濟(jì)管理學(xué)院、護(hù)理學(xué)院、外國語學(xué)院、信息技術(shù)學(xué)院、心理學(xué)院共10所直屬學(xué)院，28個本科專業(yè)，涉及醫(yī)、管、理、工、經(jīng)、文等6個學(xué)科門類，初步形成了以中醫(yī)藥為主體、中西醫(yī)結(jié)合、多學(xué)科為支撐協(xié)調(diào)發(fā)展的辦學(xué)格局。

學(xué)校現(xiàn)有國家一級重點(diǎn)學(xué)科1個，國家二級重點(diǎn)學(xué)科2個，國家重點(diǎn)（培育）學(xué)科2個；江蘇高校優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)工程二期項目立項學(xué)科2個、重點(diǎn)序列學(xué)科2個；國家中醫(yī)藥管理局中醫(yī)藥重點(diǎn)學(xué)科33個。臨床醫(yī)學(xué)、藥理學(xué)與毒理學(xué)2個學(xué)科進(jìn)入ESI全球排名前1%。擁有中醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合3個一級學(xué)科學(xué)位授權(quán)點(diǎn)和博士后科研流動站； 二級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)14個，自主設(shè)置二級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)17個；一級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)5個，二級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)23個，自主設(shè)置二級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)19個；有專業(yè)博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)1個，專業(yè)碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)4個，具有博士生導(dǎo)師自審權(quán)和主干學(xué)科專業(yè)的教授評審權(quán)。學(xué)校現(xiàn)有國家級專業(yè)綜合改革試點(diǎn)項目2個，國家級專業(yè)5個，卓越醫(yī)生（中醫(yī)）教育培養(yǎng)計劃改革試點(diǎn)項目3個，國家級精品資源共享課程6門，國家級教學(xué)團(tuán)隊2個，國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)區(qū)1個，國家級實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心3個，國家級大學(xué)生校外實(shí)踐教育基地1個，國家級規(guī)劃教材（主編）33部,國家級教學(xué)成果4項。現(xiàn)已建成27所附屬醫(yī)院、4所中西醫(yī)結(jié)合臨床醫(yī)學(xué)院，各類教學(xué)及畢業(yè)實(shí)基地逾百所。

學(xué)校科研實(shí)力雄厚，是國家科技部新藥臨床試驗(yàn)研究（GCP）中心、國家發(fā)改委中藥資源產(chǎn)業(yè)化與方劑創(chuàng)新藥物國家地方聯(lián)合工程研究中心、國家教育部中藥炮制規(guī)范化及標(biāo)準(zhǔn)化工程研究中心、國家級中藥炮制技術(shù)傳承基地、江蘇省植物藥深加工工程研究中心、江蘇省海洋藥物研究開發(fā)中心、江蘇省中醫(yī)藥研究與新藥創(chuàng)制中心、江蘇省中藥資源產(chǎn)業(yè)化過程協(xié)同創(chuàng)新中心的依托建設(shè)單位。學(xué)校現(xiàn)有江蘇高校協(xié)同創(chuàng)新中心2個，國家地方聯(lián)合工程研究中心1個，省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1個，教育部工程研究中心1個，國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)研究室3個，國家中醫(yī)藥管理局三級實(shí)驗(yàn)室8個，江蘇省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室2個，江蘇省高校重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室4個，省級工程研究中心（工程實(shí)驗(yàn)室）6個，江蘇高校哲學(xué)社會科學(xué)重點(diǎn)研究基地1個。學(xué)校構(gòu)建形成了“一個中心、四大板塊”的科技臺布局，即江蘇省中醫(yī)藥研究與新藥創(chuàng)制中心和南京中醫(yī)藥大學(xué)科技園、南京高新技術(shù)開發(fā)區(qū)中藥產(chǎn)業(yè)園區(qū)、中國醫(yī)藥城中醫(yī)藥研究院、江蘇生命科技園，加快推進(jìn)“產(chǎn)、學(xué)、研”結(jié)合，積極為地方經(jīng)濟(jì)社會發(fā)展服務(wù)。

學(xué)校有國醫(yī)大師5人，“”特聘教授1名，國家杰出青年科學(xué)基金獲得者5人，國務(wù)院學(xué)科評議組成員3人，國家“973計劃”項目首席科學(xué)家1人，百千萬工程國家級人選5人，國務(wù)院政府特殊津貼獲得者51人，國家有突出貢獻(xiàn)中青年專家1人，國家教學(xué)名師2人，全國模范教師1人，全國優(yōu)秀教師6人。

學(xué)校是世界衛(wèi)生組織（WHO）傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)合作中心、國家衛(wèi)生部確定的國際針灸培訓(xùn)中心、全國中醫(yī)師資進(jìn)修教育基地、中國中醫(yī)藥文獻(xiàn)信息檢索中心南京分中心，同時也是首批獲國家教育部批準(zhǔn)接受和培養(yǎng)外國留學(xué)生及臺港澳地區(qū)學(xué)生的高等中醫(yī)藥院校。2010年6月20日，學(xué)校與澳大利亞皇家墨爾本理工大學(xué)合作建立了全球首家中醫(yī)孔子學(xué)院，時任國家副主席出席了揭牌儀式并發(fā)表重要講話。學(xué)校目前與世界90多個國家和地區(qū)有著廣泛交流和聯(lián)系，并與世界30多個國家和地區(qū)的政府、高等院校或?qū)W術(shù)團(tuán)體及機(jī)構(gòu)建立了友好合作關(guān)系，具有較高的國際聲譽(yù)和影響力。

面向未來，南京中醫(yī)藥大學(xué)將進(jìn)一步繼承和發(fā)揚(yáng)辦學(xué)的優(yōu)良傳統(tǒng)和作風(fēng)，不斷深化體制機(jī)制改革，大力實(shí)施“人才強(qiáng)校、質(zhì)量興校”戰(zhàn)略，加強(qiáng)內(nèi)涵建設(shè)，提升辦學(xué)水，通過辦學(xué)規(guī)模、結(jié)構(gòu)、質(zhì)量、效益的協(xié)調(diào)發(fā)展，積極創(chuàng)建“國際著名、國內(nèi)一流”的中醫(yī)藥大學(xué)，努力躋身于全國具有鮮明的高水大學(xué)行列。