學校現(xiàn)有中國語言文學研究所、中國研究中心、美國問題研究中心、歷史地理研究所、人口研究所、世界經(jīng)濟研究所、金融研究院、數(shù)學研究所、現(xiàn)代物理研究所、遺傳學研究所、上海市心血管病研究所、上海市放射醫(yī)學研究所、肝癌研究所等81個研究機構(gòu)，145個跨學科研究中心，有先進光子學材料與器件、專用集成電路與系統(tǒng)、應(yīng)用表面物理、遺傳工程、醫(yī)學神經(jīng)生物學等5個國家重點實驗室。還有10個教育部重點實驗室和7個衛(wèi)生部重點實驗室，8個教育部人文社會科學重點研究基地。
學校現(xiàn)有各類學生44,300余人，其中博士生3,500人，碩士生7500余人，普通本專科生15700余人，外國留學生2,200余人，成人教育本專科生8400人，網(wǎng)絡(luò)教育本專科生7000人。
學校擁有一支高水的師資隊伍，現(xiàn)有專任教師與科研人員2,300余人，其中教授、副教授1,350余人，中國科學院、中國工程院院士29人，博士生導(dǎo)師746人，教育部“獎勵計劃”特聘教授40人、講座教授14人，“973”首席科學家6人，“國家級有突出貢獻中青年專家”31人。幾年來，學校積極引進人才，實施教育部“獎勵計劃”，涌現(xiàn)出一批優(yōu)秀的中青年教師，優(yōu)化了師資隊伍結(jié)構(gòu)。學校還擁有中山、華山等9個附屬醫(yī)院，集醫(yī)療服務(wù)、臨床教學與科研工作于一體。醫(yī)院醫(yī)療設(shè)備先進、技術(shù)力量雄厚，有900多人具有正、副高級職稱，為臨床教學創(chuàng)造了良好的教學條件。
復(fù)旦大學把培養(yǎng)具有全面素質(zhì)的高質(zhì)量人才作為教學的根本目標。學校注意從自己的實際出發(fā)，大膽吸收國內(nèi)外高校的成功經(jīng)驗，注重加強學科間的滲透、交叉、組合，發(fā)揮綜合性大學多學科的和優(yōu)勢。經(jīng)過長期的實踐和探索，已經(jīng)建立起一套比較完整的、有自身特點的教學計劃和管理體系。學科建設(shè)全面啟動，發(fā)展勢頭良好。
學校按照“厚基礎(chǔ)、寬口徑、重能力、求創(chuàng)新”的教學理念，將綜合教育和文理基礎(chǔ)教育為的通識教育和寬口徑專業(yè)教育有機地結(jié)合起來。學校從1994年實施學分制教學管理，2001年全面推進學分制建設(shè)，通過調(diào)整課程設(shè)置、開放選擇專業(yè)、推行學期開課制、設(shè)立自由選修學分等多種途徑，從各個教學環(huán)節(jié)上落實學生個性發(fā)展，給學生以更多的自主選擇權(quán)。學校大力提倡“名教授上基礎(chǔ)課、帶基礎(chǔ)實驗”，建有嚴格的教學質(zhì)量保障體系，在歷年的全國優(yōu)秀教學成果獎評選中獲獎數(shù)始終名列全國前茅。學校建立了一套有實效、有的教學管理制度，研制和開發(fā)了具有國內(nèi)先進水的《高校網(wǎng)上教務(wù)管理系統(tǒng)》，實行導(dǎo)師制等一系列措施，全面實現(xiàn)了科學化、專業(yè)化管理，并堅持不懈地整治教風和考風，形成了良好的學風和校風。
學校把加強和發(fā)展研究生教育視為建設(shè)世界一流大學的關(guān)鍵，始終以“提高研究生培養(yǎng)質(zhì)量”，激勵研究生的創(chuàng)新能力，營造完善的成才機制和濃重的學術(shù)氛圍。積極推進招生制度改革，擴大博士生導(dǎo)師的招生自主權(quán)，通過提前攻博、碩博連讀和招收直博生制度來吸引優(yōu)秀生源。通過加強課程建設(shè)和教材建設(shè)來完善研究生學位課程體系，以嚴格的科研訓(xùn)練和能力培養(yǎng)來激發(fā)研究生的自主創(chuàng)新潛力，實施學位論文開題報告、中期考核和博士資格考試等措施，提高研究生的培養(yǎng)質(zhì)量。年來，研究生發(fā)表的論文在質(zhì)量和數(shù)量上都有較大的提高，在連續(xù)六屆的全國百篇優(yōu)秀博士學位論文評選中，我校有33篇入選，在全國名列第三。為適應(yīng)國家現(xiàn)代化建設(shè)的要求，年來著力于研究生教育專業(yè)結(jié)構(gòu)的調(diào)整，大力發(fā)展專業(yè)學位研究生的培養(yǎng)，取得了很好的成效，得到社會的廣泛認同。在2001年亞洲13所著名商學院參加的“亞洲創(chuàng)業(yè)計劃大賽”上，我校MBA代表隊囊括全部單項與總分冠軍，在全國“華為杯”研究生電子設(shè)計大賽中，我校多次獲團體和個人冠軍。在第一屆100名國家教學名師獎評審中，復(fù)旦2位教授獲得殊榮；上海市首屆52名教學名師獎評選中，有8名教授入選，居上海市各高校之首。
學校注重課堂內(nèi)外教育的結(jié)合，鼓勵學生開展學術(shù)研究和社會實踐。設(shè)立了“學生科技創(chuàng)新基金”，“大學生暑期社會實踐基金”，開辦百臺精品講座，倡導(dǎo)讀百本書，參加百項社會實踐和實驗課題，使以德育，培養(yǎng)創(chuàng)新能力和實踐能力，德、智、體、美相互滲透的素質(zhì)教育，成為校園生活的主旋律。在反映學生科技創(chuàng)新能力的全國大學生“挑戰(zhàn)杯”比賽中，復(fù)旦大學在1995年、2000年、2001年和2005年四次獲得第一名，是獲得第一名最多的學校。學生話劇團經(jīng)常在校園上演世界名劇和自編自導(dǎo)自演的新戲。校男女排球隊都是全國甲級隊。藝術(shù)體操、射擊是復(fù)旦大學的傳統(tǒng)體育項目，在全國大學生比賽中屢次奪冠。
復(fù)旦努力以一流的師資，一流的管理，培養(yǎng)出一流的復(fù)旦人才。復(fù)旦培養(yǎng)的人才，在各自崗位上大顯身手，贏得了社會的肯定和用人單位的普遍歡迎。本科畢業(yè)生絕大多數(shù)在4月底前能落實單位，五、六家單位爭奪一名畢業(yè)生的現(xiàn)象也不乏其例。在全國高校畢業(yè)生就業(yè)市場競爭日益激烈的情況下，復(fù)旦本科生當年就業(yè)率年來始終在95%以上。從畢業(yè)生流向，也可看出復(fù)旦人在社會發(fā)展中所擔當?shù)慕巧�。進入國家機關(guān)的人數(shù)占畢業(yè)總?cè)藬?shù)的6%～7%，直升或考取研究生，以及留在高校及科研單位的約占40%。金融單位、各類公司企業(yè)、律師、會計師事務(wù)所等比例均較高。用人單位普遍反映，復(fù)旦的學生大多數(shù)具備自信心強、有協(xié)作精神、適應(yīng)能力強等諸多優(yōu)點，在工作中往往能脫穎而出。
復(fù)旦大學科技工作以面向國際科學前沿、面向國家戰(zhàn)略需求、面向國民經(jīng)濟主戰(zhàn)場為指針，以開展原始性科學創(chuàng)新研究、出一流科技人才與科技成果、服務(wù)于國家安全與區(qū)域發(fā)展為目標，以承擔國家與地方重大科技項目、建設(shè)重大科學臺、培育優(yōu)秀創(chuàng)新團隊為抓手。作為首席科學家單位，目前承擔國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展規(guī)劃項目（973項目）6項，國家自然科學基金重大項目1項。2004年獲批準國家自然科學基金重點項目11項，上海市重大項目6項，獲國家自然科學基金委優(yōu)秀創(chuàng)新研究群體1個，獲得國家級科技成果獎勵4項，獲得授權(quán)專利105項，發(fā)表SCI論文944篇。幾年，學校面向國民經(jīng)濟主戰(zhàn)場，在專用集成電路、計算機網(wǎng)絡(luò)工程、生物技術(shù)、有機納米材料和催化劑研究等方面開發(fā)了一系列科技成果，產(chǎn)生了顯著的社會與經(jīng)濟效益。在非線性數(shù)學、先進材料、人類基因組學、基礎(chǔ)醫(yī)學與臨床醫(yī)學等領(lǐng)域取得了重要的科技進展。
人文科學和社會科學研究方面，在歷屆上海市哲學社會科學優(yōu)秀成果評選中，復(fù)旦的獲獎等級和總數(shù)都以絕對優(yōu)勢領(lǐng)先，其中《中國歷史地圖集》、《英漢大詞典》、《中國文學批評通史》獲特等獎；有5項成果獲2000年首屆全國哲學社會科學基金規(guī)劃項目優(yōu)秀成果獎，其中由陸谷孫教授主編的《英漢大詞典》獲一等獎，是上海地區(qū)唯一的一等獎獲得者。在2003年教育部中國高校第三屆人文社會科學優(yōu)秀研究成果獎的評比中，我校有5部著作榮獲一等獎，獲一等獎著作數(shù)排名全國第一。2004年我校獲上海市哲學社會科學優(yōu)秀成果獎82項，鄧小理論研究與宣傳優(yōu)秀成果獎12項，蔣學模、劉放桐獲得首次設(shè)立的學術(shù)貢獻獎；在2004年上海市的社科評獎中，我校獲獎總數(shù)占全市的32%。2004年我校又獲上海市決策咨詢研究成果獎8項，獲獎總數(shù)大幅度提高并首次位列上海高校第一。在2003年、2004年、2005年國家社科基金項目評審中，我校分別有20、28、23個項目立項，立項數(shù)連續(xù)數(shù)年位列上海高校第一。復(fù)旦還多次獲得中國圖書一等獎、“五個一工程”優(yōu)秀圖書獎、上海市優(yōu)秀圖書特等獎等獎項。
復(fù)旦大學積極興辦科技產(chǎn)業(yè)，推動產(chǎn)、學、研聯(lián)合，促進科技成果轉(zhuǎn)化。通過探索和實踐，吸取了國內(nèi)外有益的經(jīng)驗，實施多種模式發(fā)展科技產(chǎn)業(yè)，使學校科技成果轉(zhuǎn)化及產(chǎn)業(yè)化工作得到了很大的發(fā)展，并且打造出了生機勃勃的“復(fù)旦”校辦產(chǎn)業(yè)群，開辟出一條具有“復(fù)旦”的產(chǎn)業(yè)化之路。2004年，復(fù)旦大學國家大學科技園在英國威爾士南部設(shè)立辦事機構(gòu)，成功打開通往歐洲市場的大門。現(xiàn)有上市公司3家，其中香港創(chuàng)業(yè)板上市公司2家，如上海復(fù)旦微電子股份有限公司，是國內(nèi)首家專門從事超大規(guī)模集成電路設(shè)計、開發(fā)、生產(chǎn)、銷售的發(fā)起式股份有限公司，它是在香港上市的第一個復(fù)旦大學品牌的高科技企業(yè)，在“亞洲金融”雜志評出的2001年度中國大陸地區(qū)最佳企業(yè)排行榜上，該公司列為第10位，它的“神威1號”嵌入式32位微處理器的項目獲得國家國防科技一等獎。
學校目前占地面積252萬方米，校舍建筑面積111萬方米，全校固定資產(chǎn)22億元。學校現(xiàn)有各類實驗室134個，其中有5個國家重點實驗室，20個省部級重點實驗室；擁有文理醫(yī)3個圖書館，全校現(xiàn)有藏書445萬冊，居全國高校前列。
復(fù)旦大學已成為國際上有影響的學術(shù)中心之一，具有廣泛緊密的國際聯(lián)系，學術(shù)交流活動非常活躍，已與30個國家和地區(qū)的150多所高校和研究機構(gòu)建立了合作交流關(guān)系，并向300多位國際知名學者和人士授予了名譽博士、名譽教授、顧問教授等稱號。美國前總統(tǒng)里根、法國前總統(tǒng)德斯坦、荷蘭前首相呂貝爾斯、以色列前總理拉賓、德國總統(tǒng)約翰內(nèi)斯?勞、德國前總理科爾、美國副總統(tǒng)切尼等外國元首或政府首腦，曾到復(fù)旦訪問并發(fā)表演講。復(fù)旦大學是全國四個對外漢語教學基地之一，留學生數(shù)名列全國第二。在校學生國際校際交流數(shù)不斷增加，2004年出國出境學習學生達到637名，開拓了學生的眼界。復(fù)旦大學積極參與各類重要國際大學組織，繼1998年成功舉辦東亞研究型大學年會之后，2000年成功舉辦21世紀大學校長協(xié)會第4次年會，2001年又成功舉辦了“環(huán)太洋大學協(xié)會”第5次年會。隨著國際地位的提升，復(fù)旦主辦了相當多的學術(shù)會議，2002年學校主辦了國際數(shù)學聯(lián)盟執(zhí)委會會議、國際合成金屬會議和第七屆世界對外漢語教學會議等高規(guī)格、大規(guī)模的國際學術(shù)會議，2004年舉辦國際學術(shù)會議60場次。復(fù)旦大學積極推進國際化進程，與美國耶魯大學、日本早稻田大學、新加坡國立大學等世界著名大學建立了戰(zhàn)略合作伙伴關(guān)系，2004年與27個國外大學及學術(shù)機構(gòu)簽訂了交流協(xié)議。復(fù)旦校董會熱心學校工作，學校每年都得到國內(nèi)外校董及社會各界的大力資助。
日月光華，旦復(fù)旦兮。在國家教育部和上海市政府的重點投資下，復(fù)旦這所百年名校正力爭建設(shè)成為一所立足上海、服務(wù)全國、國際一流的高水、研究型的世界一流綜合性大學，為人類文明進步，不斷探索教育、科技創(chuàng)新和制度創(chuàng)新成果。